Les projets du département de l'enseignement supérieur s'insèrent dans les Espaces 2, 3 et 4 et sont répartis entre le Projet 12 et le Projet 23.
Projet 12 : Promotion de l'excellence
Projet 13 : Amélioration de l'offre d'enseignement supérieur
Projet 14 : Promotion de la recherche Scientifique
Projet 15 : Renforcement des compétences des personnels de l'enseignement
Projet 16 : Renforcement des mécanismes d'encadrement, de suivi et d'évaluation
Projet 17 : Optimisation de la gestion des ressources humaines
Projet 18 : Parachèvement de la mise en œuvre de la déconcentration
Projet 19 : Planification et gestion du Système d'Éducation et de Formation
Projet 20 : Maîtrise des langues
Projet 21 : Mise en place d'un système d'information et d'orientation efficient
Projet 22 : Optimisation et pérennisation des ressources financières
Projet 23 : Mobilisation et communication autour de l'Ecole